O navio está igualmente preparado para apoiar os órgãos de proteção civil regionais em situações de calamidade ou catástrofe naturais bem como para cooperar com outros departamentos do Estado com competências no mar.
O NRP João Roby realizou duas missões às ilhas Selvagens, onde colaborou com a Autoridade Marítima no transporte de material e pessoal e efetuou a rendição dos vigilantes do Instituto das Florestas e Conservação da Natureza.
