​No quadro dos compromissos internacionalmente assumidos por Portugal, a missão do NRP Arpão consiste na recolha de informações na área atribuída aquela força da EU, nomeadamente no estabelecimento dos padrões de navegação, contribuindo desta forma para o combate às redes de tráfico de migrantes, combate ao tráfico ilegal de armas e de combustível, que assola aquela região central do Mediterrâneo.

Com esta missão o submarino Arpão irá fazer valer a elevada tecnologia de que está equipado, sendo um meio adequado à recolha de informações de forma discreta numa área com as características daquela região do mediterrâneo central.

O NRP Arpão, comandado pelo Capitão-tenente Paulo Alexandre Lourenço Henriques Frade, tem uma guarnição de 8 oficiais, 13 sargentos e 13 praças.